Koubek döntéséről úgy nyilatkozott, hogy ahhoz hozzájárult az ellene irányuló, „féligazságokon és kitalációkon” alapuló médiakampány. Hozzátette: a kialakult légkörben nem látta értelmét a további munkának a cseh válogatottnál.
A rutinos futballistákat felvonultató csehek a vb csoportkörében egy pontot szereztek, ezzel négyesük utolsó helyén végezve estek ki. Az együttes kezdésként a dél-koreaiaktól kapott ki 2-1-re, majd zárásként a társrendező mexikóiaktól 3-0-ra, a kettő között pedig 1-1-es döntetlent ért el a dél-afrikaiakkal szemben. A 74 éves szakember munkáját a torna alatt folyamatosan kritika érte a cseh sajtó részéről, míg Koubek a vártnál gyengébb teljesítményüket „buta hibákkal” indokolta, valamint azzal, hogy a sok utazgatás kimerítette a játékosait. A csapat mindhárom vb-meccsét más stadionban játszotta, mexikói mérkőzéseik között Atlantában léptek pályára.
Koubek tavaly októberben, a Feröer-szigetekkel szemben a selejtezőben elbukott mérkőzés után vette át a válogatott irányítását, és az európai pótselejtezőn kvalifikálta együttesét a vb-re. A csehek 2006 után szerepeltek ismét a tornán.
A kieső csapatok kapitányai közül nem Koubek az első, aki felállt: Skócia részéről Steve Clarke, Dél-Koreától pedig Hong Mjongbo is lemondott, utóbbi halálos fenyegetéseket is kapott a torna után.